Відповідно до п.п. 209.2.4 п. 209.2 ст. 209 Податкового кодексу України від 02 грудня 2010 року № 2755-VІ зі змінами та доповненнями (далі – ПКУ) сільськогосподарські підприємства - суб’єкти спеціального режиму оподаткування у строки, встановлені ПКУ для самостійної сплати податкових зобов’язань, повинні забезпечити перерахування на їхні рахунки у системі електронного адміністрування податку, зазначені у п.п. 209.2.1 п. 209.2 ст. 209 ПКУ, коштів у розмірі, достатньому для перерахування до державного бюджету та на спеціальний рахунок, на підставі поданої податкової декларації, в якій відображаються результати діяльності в межах спеціального режиму оподаткування протягом звітного (податкового) періоду.
Пунктом 23 Порядку електронного адміністрування податку на додану вартість, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 16 жовтня 2014 року № 569 із змінами і доповненнями (далі – Порядок № 569), визначено, що позитивна різниця між сумою податкових зобов’язань звітного (податкового) періоду та сумою податкового кредиту звітного (податкового) періоду за операціями, зазначеними в абзацах другому - четвертому п. 23 Порядку № 569, підлягає перерахуванню окремо в межах кожного виду зазначених операцій в розмірах, визначених п. 209.2 ст. 209 ПКУ, до державного бюджету та, зокрема, на спеціальний рахунок суб’єкта спеціального режиму оподаткування.
Для перерахування суб’єктами спеціального режиму оподаткування сум податку за операціями, зазначеними в абзацах другому - четвертому п. 23 Порядку № 569, до державного бюджету та на їх спеціальні рахунки такі підприємства зараховують кошти на власні додаткові електронні рахунки залежно від виду операцій, зазначених в абзацах другому - четвертому п. 23 Порядку № 569.
Перерахування коштів з додаткових електронних рахунків, зазначених в абзаці третьому п. 4 Порядку № 569, здійснюється Державною казначейською службою автоматично протягом операційного дня, що настає за днем, в якому кошти надійшли на такі рахунки.
Отже якщо на електронні рахунки помилково перераховані кошти, які не відповідають зазначеному виду операцій, то відповідно відбувається недостовірне зарахування таких коштів як до бюджету, так і на спеціальний рахунок суб’єкта спеціального режиму оподаткування.
При цьому переплата, яка виникає у разі надмірного зарахування коштів до бюджету може бути повернена з урахуванням положень абзацу п’ятого п. 200 прим. 1.4 ст. 200 прим. 1 та другого речення п. 43.4 ст. 43 ПКУ.
У випадку надмірного перерахування коштів на спеціальний рахунок, зазначені кошти поверненню платнику податку не підлягають, а враховуються таким платником в рахунок майбутніх нарахувань та можуть бути використані ним для відшкодування суми податку, сплаченої (нарахованої) постачальнику на вартість виробничих факторів, за рахунок яких сформовано податковий кредит, а за наявності залишку такої суми податку - для інших виробничих цілей.
З цим та іншими роз’ясненнями можна ознайомитися уЗагальнодоступному інформаційно-довідковому ресурсі ДФС України (дане роз’яснення у категорії 101.21).